Khi hôn mê, trong và ngoài tế bào diễn ra hai quá trình đối nghịch; nhiễm toan ỗ trong tế bào, nhiễm kiềm ỏ ngoài tế bào. Sự phân bố lại các chất điện giải do tăng tính thấm màng tế bào. Nhiễm toan trong tế bào do gan giảm tiêu tầụ glucoza và oxy, và do acid pyruvic, acid lactic, V.V.... ứ đọng do rối loạn chuyền hoá vòng Krebs.

Do hậu quả của những rối loạn trên sự sản xuất năng lượng trong mô não bị giảm sút nghiêrạ trọng, hoạt động điện não, các quá trình tổng hạp trong, tế bào não rối loạn. Hoạt động thần kinh trung ương bị ức chế dẫn đến những rối loạn tâm thần - thần kinh.

Sự khởi phát rất nhanh, cũng như sự rút lui níiánli cua hôn mê khi ghép gan thành công cũng ỊỊÓi lên nguyên nhân của hôn mê là do rối loạn chuyển hoá chứ không phải do tổn thương thực thể của mô thần kinh [5, 4].;.

Gần đây ngưòi ta quan tâm nhiều đến vai trò của các amin dẫn truyền thần kinh trong hôn mê gan. Parkes và cs (1970) thấy sau khi uống levodopa tri giác của bệnh nhân hôn mê tốt hẳn lên. Williams [5] cũng báo cáo một trường hợp hôn mê sau dùng levođopa tỉnh lại, nói chuỳện được đồng thòi điện não cũng tốt lên rõ rệt mặc dầu chỉ tạm thòi. Tác dụng của thuốc còn cần tiếp tục nghiên cứu, dù sao cũng nói lên tình trạng có thể đảo ngược được hôn mê gan.